劳务派遣属于人力资源服务，适用税率是6%，按照财税〔2016〕47号，可以选择差额纳税，以取得的全部价款和价外费用，扣除代用工单位支付给劳务派遣员工的工资、福利和为其办理社会保险及住房公积金后的余额为销售额，按照简易计税方法依5%的征收率计算缴纳增值税。
劳务外包，则应按照其业务实质，全额计算缴纳增值税。比如，外包的是加工、修理修配劳务，则承包单位应按提供加工、修理修配劳务的计税规则全额计算缴纳增值税；外包的如果是建筑服务，则承包单位应按提供建筑服务的规定计算缴纳增值税（一般纳税人9%或小规模纳税人3%）。
主要区别有以下几点：
（一）资质要求
劳务派遣公司必须取得人力资源部门核发的劳务派遣资质证书。
（二）签订的合同不同
一是劳务派遣公司应依法与被派遣的劳动者签订规范的劳动合同，并按照人力资源部门的要求实行网上备案。劳动合同中应载明被派遣的劳动者的用工单位、派遣期限、岗位等情况；
二是劳务派遣公司应与用工单位签订劳务派遣合同，载明被派遣人员的工资、保险、公积金等数额。
（三）是否通过金融机构支付工资
劳务派遣公司支付给被派遣劳动者的工资必须通过银行转账方式，要有明细的银行流水单据。
（四）扣除凭证不同
扣除凭证除了第二项中的两个合同和第三项中的银行单据之外，还需要劳务派遣公司的花名册、用工单位的花名册、劳务派遣公司和用工单位的工资核算明细账，以及劳务派遣公司为劳动者缴纳社会保险的缴费凭证。
（五）发票开具不同
选择差额征税的，扣除的差额部分不得开具专用发票，可以通过防伪税控系统的差额开票功能，差额开具发票。同时，需要在备注栏中备注上支付给劳动者的工资和五险一金的数额。
（六）加强对劳务派遣公司和用工单位的企业所得税年度审核鉴证
严格执行国税函（2009）3号和2015年34号公告，不符合规定的工资和福利费，不允许税前扣除，更防止一笔工资两头扣除。
（七）加强部门协作
营改增前成立的劳务派遣公司，企业所得税一般都在税务部门可信息共享，协调办案。同时，税务、工商、人力资源、银行等部门，可联合加强对劳务派遣的监督管理，实现信息共享，业务互通。
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